Dalam upaya Program Studi Peternakan Fakultas Pertanian Universitas Mulawarman meningkatkan kualiatas pendidikan dalam proses dan hasil pembelajaran maka Program Studi Peternakan memberlakukan beberapa indikator kinerja tambahan yaitu dengan menerapkan sistem pembelajaran active-learning, di mana dalam proses kegiatan pembelajaran atau perkuliahan, dosen bertindak sebagai fasilitator. Dosen memberikan kepada mahsiswa tema-tema pokok mengenai materi perkuliahan, kemudian dielaborasi oleh mahasiswa dengan melakukan kegiatan diskusi, pada akhir perkuliahan dosen membuat kesimpulan terhadap materi perkuliahan.

Khusus pemanfaatan jaringan internet, materi perkuliahan di setiap pertemuan dilampirkan dalam bentuk power point. Materi perkuliahan di setiap pertemuan diunggah ke dalam aplikasi Mulawarman Online Learning System (MOLS) sehingga setiap mahasiswa memungkinkan untuk mengaksesnya kembali materi yang telah selesai. selain itu penerapan sistem perkuliahan berbasis E-learning telah dilakukan oleh Program Studi Peternakan dengan membatasi dosen maksimal 30% dari jumlah seluruh pertemuan tatap muka.

Kurikulum yang dikembangkan program studi Peternakan memiliki standar kompetensi kelulusan yang sistematis dan terstruktur, yang terdiri dalam kompetensi utama, kompetensi pendukung, kompetensi penunjang yang berguna untuk tercapainya tujuan, terlaksananya misi, dan mewujudkan visi yang telah ditetapkan. Kompetensi utama yang wajib dimiliki oleh lulusan Program Studi Peternakan adalah mampu menjalankan mandat untuk peningkatan hasil kerja dan mampu memberi keteladanan sikap dan perilaku berdasarkan etika dan profesinya. Salah satu indikator keberhasilan Program Studi Peternakan adalah lulusan memiliki kemampuan untuk berperan dalam memberikan kontribusi terhadap kebutuhan masyarakat.